Glosari

2-Abz - 2-Aminobenzoyl, biasanya bergabung dengan 2,4-dinitrophenyl (Dnp) atau 3-nitro-tyrosine (NitroTyr) untuk membentuk pasangan Fluorophore/Quencher. pengujaan pada 320 nm, pelepasan pada 420 nm.

3-Abz (asid m-aminobenzoik) boleh dilihat sebagai asid -amino. Apabila asid m-aminobenzoik dimasukkan ke dalam rantai peptida, ia menghasilkan giliran yang tegar.

4-Abz (asid p-Aminobenzoik, PABA), sebagai terbitan asid benzoik yang wujud secara semula jadi, juga boleh digunakan sebagai pengatur jarak linear tegar.

Abu, L- -Aminobutyryl ((S)-2-Amino-butanoyl), -asid aminobutyric, ialah terbitan asid amino. Oleh kerana persamaan strukturnya dengan asid amino semulajadi, ia sering digunakan dalam reka bentuk dan sintesis peptida dan mimetik peptida.

Ac mewakili asetil. Asetilasi N-terminal ialah pengubahsuaian penstabilan biasa untuk peptida dalam alam semula jadi.

Acm, Acetamidomethyl, boleh dikeluarkan menggunakan Hg(II) atau Ag(I). Ia adalah salah satu kumpulan pelindung tiol yang biasa digunakan untuk sistein apabila mensintesis peptida dengan berbilang ikatan disulfida.

ACTH (hormon adrenocorticotropic) adalah hormon yang dirembeskan oleh pituitari anterior yang merangsang korteks adrenal untuk menghasilkan kortikosteroid.

Aad (L- -asid aminoadipik) ialah asid amino bukan proteinogenik. Strukturnya serupa dengan asid glutamat (Glu), dengan kumpulan metilena tambahan dalam rantai sampingannya.

(2-Aminoethoxy)asid asetik, juga dikenali sebagai glycine ethyl ester atau glycine ethylamide, boleh digunakan sebagai spacer atau penghubung dalam sintesis pengubahsuaian peptida.

1-(1'-adamantyl)-1-metil-etoksikarbonil, kumpulan pelindung amino yang sangat labil asid dalam sintesis peptida, boleh dinyahlindungi oleh 3% TFA/CH2Cl2

AFC (7-Amino-4-trifluoromethylcoumarin) ialah sebatian pendarfluor dengan pengujaan kumarin yang dikeluarkan pada 395-400 nm, pancaran pada 495-505 nm.

Spesies berat molekul yang lebih tinggi terbentuk kerana lekatan bukan kovalen spesies yang lebih kecil. Dalam protein khususnya, pengagregatan ialah satu bentuk denaturasi yang boleh berlaku pada permukaan nonpolar dengan struktur sekunder, seperti yang biasanya membentuk interaksi intramolekul dan tertimbus dalam -helices dan -helaian protein. Molekul berinteraksi antara satu sama lain, kadangkala membentuk bentuk polimolekul yang tidak larut. Pengagregatan berbeza dengan oligomerisasi, interaksi normal protein asli yang dilipat dengan betul untuk membentuk polimer peringkat tinggi..

AHX, Aminohexanoyl,6-asid amino heksanoik, juga disingkatkan Aca atau LC, Lazimnya diperkenalkan sebagai pengatur jarak pendek bukan kutub antara biotin, fluorofor dan jujukan peptida.

2-Asid aminoisobutirik ialah asid amino bukan protein yang jarang ditemui yang merupakan hasil akhir metabolisme pirimidin dan dikumuhkan dalam air kencing dan terdapat dalam beberapa antibiotik yang berasal dari kulat. Juga digunakan untuk menggantikan asid amino semulajadi untuk sintesis peptida.

Alkohol ialah sebatian organik yang dicirikan oleh kehadiran satu, dua atau lebih kumpulan hidroksil (−OH) yang dilekatkan pada atom karbon dalam kumpulan alkil atau rantai hidrokarbon. Alkohol peptida ialah sebatian penting secara klinikal yang tidak cukup disiasat dalam kajian hubungan struktur-aktiviti (SAR) untuk penemuan dadah. Contohnya, DAMGO ialah agonis reseptor opioid yang diubah suai oleh alkohol di terminal-C, dengan urutan Tyr-{d-Ala}-Gly-{Me-Phe}-Gly-ol. Ia mempunyai selektiviti dan pertalian yang tinggi untuk reseptor μ-opioid.

Aldehid ialah sebatian organik di mana kumpulan karbonil dilekatkan pada atom karbon di hujung rantai karbon. Peptida aldehid adalah alat penting dalam biokimia dan biologi kimia untuk perencatan dan pelumpuhan kimia protease.

Aloc - Allyloxycarbonyl, kumpulan pelindung amino (juga disingkat Alloc). Perlindungan boleh dikeluarkan dengan Pd(PPh3)4.

Penyakit Alzheimer, ditandai dengan plak -amyloid dan kusut tau, berpunca daripada masalah disfungsi sinaptik dan laluan pelepasan, menyebabkan gangguan kognitif.

7-Amino-4-methylcoumarin (AMC) ialah probe pendarfluor biasa untuk pelabelan peptida dalam kajian protease. Konjugasinya kepada peptida memadamkan isyarat pendarfluor, dan AMC yang dikeluarkan semasa pembelahan protease boleh mengukur aktiviti enzim, dengan pengujaan/pancaran maksimum 345/445 nm. Sebagai contoh, peptida pendarfluor substrat pilihan untuk menentukan aktiviti seperti trypsin proteasome yang disucikan, dengan urutan: Ac-Arg-Leu-Arg-AMC.

Atrial natriuretic peptide (ANP), hormon yang dihasilkan dan dikeluarkan oleh atria jantung sebagai tindak balas kepada peningkatan jumlah dan tekanan darah. Ia berfungsi untuk mengawal keseimbangan cecair dan tekanan darah dengan menggalakkan vasodilatasi, meningkatkan pengeluaran air kencing (diuresis), dan mengurangkan penyerapan semula natrium dalam buah pinggang. Tindakan ini membantu mengatasi kesan tekanan darah tinggi dan lebihan cecair dalam badan.

Peptida antigenik ialah urutan asid amino pendek yang diperoleh daripada protein atau biomolekul lain yang mencetuskan tindak balas imun organisma. Peptida ini diiktiraf oleh sistem imun sebagai asing atau asing kepada badan, yang membawa kepada pengaktifan sel imun seperti sel T dan sel B. Peptida antigen memainkan peranan penting dalam tindak balas imun, termasuk pengeluaran antibodi adaptif dan pembangunan memori imun. Mereka dikaji secara meluas dalam pembangunan imunologi dan vaksin kerana potensinya untuk mencetuskan tindak balas imun tertentu terhadap patogen atau sel abnormal.

Sintesis peptida asimetri dengan 2, 4, dan 8 cawangan boleh dicapai dengan memasukkan secara strategik lisin, arginin, atau asid glutamat ke dalam urutan peptida.

Dimethylarginine asimetri (ADMA, Arg(Me)2) ialah sebatian kimia semulajadi dan perencat endogen nitric oxide synthase (NOS). Fmoc-Arg(Me)2-OH (asimetri) boleh digunakan secara langsung untuk sintesis peptida yang mengandungi dimethylarginine tidak simetri.

5-Asid aminovalerik, boleh digunakan sebagai pengatur jarak atau penghubung dalam sintesis pengubahsuaian peptida.

Benzyloxymethyl (Bom) ialah kumpulan pelindung imidazol labil asid yang digunakan dalam proses Boc-SPPS untuk peptida yang mengandungi histidin. Benzyloxymethyl menghasilkan formaldehid yang sangat reaktif selepas rawatan dengan asid. Oleh itu, Bom adalah terbelah terbaik dengan kehadiran Cys, methoxyamine atau sebatian lain yang bertindak balas dengan aldehid.

-asid amino mempunyai kumpulan aminonya yang terikat pada -karbon, iaitu atom karbon kedua dari kumpulan karboksil. Formula struktur am untuk asid -amino boleh diwakili sebagai: R−CH(NH2)−COOH

B-type natriuretic peptide(BNP), hormon yang dihasilkan terutamanya oleh ventrikel jantung sebagai tindak balas kepada regangan berlebihan sel otot jantung. Ia memainkan peranan penting dalam mengawal tekanan darah dan keseimbangan cecair, terutamanya dengan menggalakkan vasodilatasi dan meningkatkan perkumuhan natrium melalui buah pinggang.

t-Butyloxycarbonyl (Boc) ialah kumpulan pelindung asid-labilea-amino yang sangat dalam sintesis peptida, boleh dibelah oleh TFA/metilena klorida (1:1), HCl dalam etil asetat atau dioksana, 98% asid formik.

2-(4-Biphenylyl)isopropyloxycarbonyl (Bpoc) ialah kumpulan pelindung asid-labilea-amino yang sangat dalam sintesis peptida, boleh dibelah oleh dengan 1% TFA/methylene chloride.

Peptida dengan 2, 4, dan 8 cawangan boleh dicapai dengan memasukkan secara strategik lisin, arginin, atau asid glutamat ke dalam urutan peptida.

t-Butyldimethylsilyl (TBS atau TBDMS) ialah kumpulan pelindung hidroksil yang serasi dengan Fmoc-SPPS. Ia tahan asid dan boleh dibelah secara selektif oleh ion fluorida.

Benzoyl ialah kumpulan asil yang sering diperkenalkan pada terminal-N peptida. Ia kurang polar daripada asetil (Ac) dan boleh menjadi pengubahsuaian kekal.

Benzyl (Bzl) sisa alkil dan kumpulan pelindung rantai sisi yang digunakan untuk menyekat alkohol (Ser, Thr, Hyp) dalam sintesis peptida. ia boleh dibelah oleh asid kuat atau hidrogenolisis pemangkin (cth hidrogen/Pd).

Cholecystokinin (CCK) adalah hormon peptida yang dihasilkan oleh mukosa usus atas dan terdapat dalam sistem saraf pusat. Ia merangsang pengecutan pundi hempedu, pembebasan enzim pankreas, dan mempengaruhi pelbagai proses gastrousus.

Calcitonin gen-related peptide (CGRP) ialah 37-peptida asid amino yang berkaitan dengan calcitonin, amylin dan adrenomedullin. Ia wujud dalam dua bentuk, -CGRP (CGRP I) dan -CGRP (CGRP II), dengan aktiviti biologi yang serupa. CGRP terutamanya ditemui dalam neuron deria dan pusat, mempengaruhi fungsi kardiovaskular, metabolisme kalsium, dan nada vaskular fetoplacental. Reseptornya digabungkan dengan protein G dan mengaktifkan siklase adenilat, berinteraksi dengan protein pengubahsuai aktiviti reseptor (RAMP) untuk kekhususan ligan dan pemerdagangan selular.

L-Cyclohexylalanine (Cha) ialah sejenis asid amino non-polar analog fenilalanin, di mana cincin aromatik digantikan oleh cincin sikloheksana. Penggantian ini membolehkan mengkaji peranan asid amino aromatik dalam interaksi seperti interaksi π-π dengan menggantikan sisa fenilalanin dengan Cha dalam eksperimen.

L- -Cyclohexylglycine (Chg) ialah asid amino bukan kutub yang terhalang secara sterik. Ia berfungsi sebagai perantara farmaseutikal yang penting dan juga terdapat dalam produk semula jadi.

Kolesterol dihasilkan secara semula jadi oleh hati dan sel-sel lain dalam badan, tetapi ia juga boleh datang daripada makanan yang kita makan, terutamanya daripada produk haiwan seperti daging, ayam, dan produk tenusu penuh lemak. Kolesterol boleh dikaitkan dengan peptida untuk meningkatkan farmakokinetik.

cis-Hydroxyproline, stereoisomer trans-hydroxyproline semula jadi.

Citrulline hadir dalam protein hasil daripada pengubahsuaian enzimatik pasca translasi sisa arginin.

CMK ialah perencat kinase RSK2 dengan potensi yang sama tetapi kurang kestabilan kimia berbanding FMK.

Peptida natriuretik jenis C (CNP) ialah peptida oleh sel endothelial vaskular, yang terkenal dengan kesan vasodilatornya. Ia mempamerkan persamaan struktur dan fisiologi kepada peptida natriuretik atrium dan otak (ANP dan BNP).

L- -Cyclopentylglycyl (Cpg), ialah asid amino bukan kutub yang terhalang secara sterik.

Dalam jujukan peptida, sisa unik yang disambungkan kepada jujukan linear oleh kumpulan aminonya, meninggalkannya dengan kumpulan karboksi bebas. Kumpulan karboksil sisa ini boleh mengalami pengubahsuaian seperti amidasi atau, dalam kes seperti piroglutamat, laktamisasi dalaman.

Sianin 3 ialah pewarna sianin pendarfluor merah yang biasanya teruja oleh sumber cahaya sekitar 558 nm dan memancarkan cahaya pada kira-kira 572 nm.

Cyanine 5 ialah fluorophore pewarna sianin yang memancarkan pendarfluor inframerah dekat yang biasanya teruja oleh sumber cahaya sekitar 646 nm dan memancarkan cahaya pada kira-kira 664 nm.

L- , -Asid diaminobutirik ialah asid ,ω-diamino, analog yang lebih pendek bagi ornithine (Orn) dan lisin (Lys). Dengan perlindungan yang sesuai, asid ,ω-diamino boleh diubah suai secara terpilih pada kedudukan Nωnya atau digabungkan untuk mencipta peptida atau dendrimer bercabang.

3-(Dimethylaminoazo)benzena-4-asid karboksilik, ialah kromofor yang dikaitkan dengan kumpulan amino yang digunakan dalam aplikasi biokimia dan biologi molekul sebagai pelindapkejutan dalam pemindahan tenaga resonans pendarfluor (FRET), contohnya dengan EDANS. Pengujaan DABCYL pada 454 nm.

Dabsyl ,4-dimethylaminobenzenesulfonyl chloride, Kromofor yang dipautkan kepada kumpulan amino yang digunakan sebagai pelindapkejut dalam kombinasi, cth dengan EDANS. Pengujaan Dabsyl pada 436 nm.

4-Dimethylamino-1-naftalena-sulfonil, fluorofor yang dikaitkan dengan kumpulan amino, pengujaan pada 342 nm, pancaran pada 562 nm.

L- , -Asid diaminopropionic (Dap atau Dpr) ialah asid ,ω-diamino, yang merupakan analog yang lebih pendek daripada asid diaminobutirik (Dab), ornithine (Orn), dan lisin (Lys). Terbitan diubah suai bagi asid ,ω-diamino boleh diubah secara selektif pada kedudukan Nωnya atau digabungkan untuk mencipta peptida atau dendrimer bercabang.

1-(4,4-Dimetil-2,6-dioxocyclohex-1-ylidene)etil (Dde) ialah kumpulan pelindung amino yang digunakan dalam sintesis peptida. Ia boleh dibelah secara selektif menggunakan hidrat hidrazin 2% dalam dimetilformamida (DMF). Nω-Dde membenarkan penyingkiran khusus Dde daripada asid amino seperti Dap, Dab, Orn, atau Lys selepas sintesis peptida fasa pepejal Fmoc (SPPS), memudahkan pengubahsuaian pada-resin bagi kumpulan Nω-amino.

Ikatan disulfida ialah ikatan kovalen yang terbentuk antara dua kumpulan sulfhidril (-SH) sisa sistein dalam protein.

2,4-dimethoxybenzyl ialah kumpulan pelindung formamide labil asid yang digunakan untuk pengubahsuaian tulang belakang boleh balik dalam sintesis peptida. Ia digabungkan semasa sintesis peptida fasa pepejal (SPPS) sebagai asid amino atau dipeptida Fmoc-Dmb (Fmoc-Xaa-DmbYaa-OH), di mana Fmoc menghalang pengagregatan peptida dan dengan itu menggalakkan pemanjangan yang cekap. Dmb juga menggalakkan tindak balas kitaran dan menghalang pembentukan asparagimide. Tidak seperti derivatif Hmb, Dmb tidak membentuk benzoksazepin semasa pengaktifan.

2,4-Dinitrophenyl ialah kromofor yang terkonjugasi kepada kumpulan amino, biasanya digunakan sebagai pelindapkejutan dalam substrat pemindahan tenaga resonans pendarfluor (FRET).

4,4'-Dimethoxydityl, juga dikenali sebagai bis-(4-methoxyphenyl)methyl, ialah kumpulan pelindung karbokamida labil asid yang serasi dengan sintesis peptida fasa pepejal Fmoc (SPPS).

DOPA, 3,4-dihydroxyphenylalanine, ialah pelopor kepada beberapa neurotransmiter penting, termasuk dopamin, norepinephrine dan epinephrine.

(4,7,10-Tricarboxymethyl-1,4,7,10-tetraazacyclododecyl)-asid asetik, disingkatkan sebagai DOTA, ialah chelator kitaran yang biasanya dilekatkan pada terminal-N peptida. DOTA memudahkan pelabelan peptida dengan radionuklid seperti 68Ga atau 90Y untuk pelbagai aplikasi bioperubatan, termasuk pengimejan dan terapi sasaran.

Difenilmetil (dityl), kumpulan pelindung N-, O- dan S yang labil asid.

Asid Diethylenetriaminepentaacetic (DTPA) ialah agen pengkelat yang berguna untuk radionuklid seperti (68)Ga, (99m)Tc dan (111)In, yang boleh digunakan untuk pengimejan perubatan nuklear.

5-[(2-Aminoethyl)amino]naftalena-1-asid sulfonat (EDANS) ialah fluorophore yang biasanya dikaitkan dengan Nω asid diamino seperti lisin. Ia kerap digunakan dalam substrat FRET, biasanya dipasangkan dengan pelindapkejut seperti DABCYL. EDANS mempunyai panjang gelombang pengujaan 340 nm dan memancarkan pada 490 nm.

Polipeptida pengaktif monosit endothelial.

Etil, kumpulan alkil dan homolog metil (Me), digunakan untuk pengubahsuaian N- dan S-etilasi kekal dalam peptida.

Pemetaan epitope (pemetaan epitop antigen) ialah teknik yang digunakan untuk menentukan kawasan tertentu (iaitu, epitop antigen) pada antigen yang boleh dikenali oleh antibodi atau sistem imun. Epitop antigen boleh dibahagikan kepada epitop linear dan epitop konformasi. Melalui pemetaan epitope antigen, kita dapat memahami dengan mendalam hubungan antara struktur dan fungsi antigen, yang sangat penting dalam pembangunan vaksin, diagnosis penyakit, imunoterapi dan aspek lain.
Beberapa kaedah pemetaan epitope antigen yang biasa digunakan termasuk:
Penghabluran sinar-X: Ia boleh menganalisis secara langsung struktur tiga dimensi antigen, dengan itu menentukan kedudukan epitope.
Resonans magnetik nuklear: Ia juga boleh digunakan untuk menganalisis struktur antigen untuk menentukan epitope.
Teknik pengimbasan peptida: Menggunakan satu siri segmen peptida sintetik yang bertindih untuk mengenal pasti epitope yang mengikat antibodi.
Sebagai contoh, dalam penyelidikan dan pembangunan vaksin, menjelaskan epitope utama pada antigen membantu mereka bentuk vaksin yang lebih berkesan dan mendorong tindak balas imun yang lebih disasarkan; dalam diagnosis penyakit, menentukan epitop antigen yang berkaitan dengan penyakit tertentu boleh membangunkan reagen diagnostik yang lebih tepat.

5-FAM (5-Carboxyfluorescein) ialah fluorophore yang biasa digunakan untuk melabelkan biomolekul, dengan panjang gelombang pengujaan 490 nm dan pancaran pada 520 nm.

Fluorescein-6-karbonil ialah fluorophore yang melekat pada kumpulan amino, dengan panjang gelombang pengujaan 490 nm dan pancaran pada 520 nm.

Fluorescein isothiocyanate (FITC) ialah fluorophore yang bertindak balas dengan kumpulan amino. Apabila menandai peptida pada terminal-Nnya dengan FITC, pengatur jarak seperti -alanine atau Ahx biasanya dimasukkan. FITC mempunyai panjang gelombang pengujaan 490 nm dan pancaran pada 520 nm.

9-Fluorenylmethyl ialah kumpulan pelindung asas-labil yang digunakan untuk perlindungan O- dan S.

FMK, fluoromethyl ketone, adalah perencat tak boleh balik kinase RSK2.

9-Fluorenylmethoxycarbonyl (Fmoc), kumpulan pelindung amino dalam sintesis fasa pepejal FMOC, boleh dialih keluar dengan 20% piperidine/DMF.

Formyl ialah kumpulan pelindung indol yang digunakan dalam Boc-SPPS. Trp(For) dibelah oleh HF dengan kehadiran merkaptan atau oleh bes seperti piperidine.

Pemindahan tenaga resonans pendarfluor (FRET) ialah pemindahan tenaga bukan sinaran daripada fluorophore (penderma) yang teruja kepada penerima yang sesuai (pelindapkejut). Pemindahan bergantung pada jarak, orientasi dipol, dan pertindihan spektrum penderma dan penerima. Dalam substrat FRET, fluorophore dan pelindapkejut dikaitkan melalui rantai peptida. Pembelahan enzimatik meningkatkan pendarfluor dengan memisahkan penderma dan penerima.

Pendarfluor ialah cahaya yang dipancarkan oleh bahan yang menyerap cahaya atau sinaran elektromagnet lain. Ini berlaku apabila molekul yang dipanggil fluorofor menyerap foton dengan panjang gelombang tertentu, menjadi teruja, dan kemudian memancarkan foton dan kembali ke keadaan asasnya. Cahaya yang dipancarkan biasanya mempunyai panjang gelombang yang lebih panjang dan tenaga yang lebih rendah daripada cahaya yang diserap, menghasilkan spektrum pendarfluor ciri. Fenomena ini digunakan secara meluas untuk pelbagai tujuan saintifik dan perubatan, termasuk mikroskopi, sitometri aliran, dan spektroskopi pendarfluor.

Polipeptida perencatan gastrik (GIP), juga dikenali sebagai peptida insulinotropik yang bergantung kepada glukosa, tergolong dalam keluarga hormon secretin. Ia merangsang rembesan insulin, menghalang rembesan asid gastrik, dan memainkan peranan penting dalam mengawal rembesan insulin dan homeostasis glukosa.

L- -Asid karboksiglutamat (Gla) terbentuk melalui karboksilasi pasca translasi asid glutamat, menghasilkan protein yang mampu mengikat ion kalsium, seperti osteocalcin. Peptida yang mengandungi gla disintesis secara ideal menggunakan sintesis peptida fasa pepejal Fmoc (SPPS), kerana Gla boleh menjalani dekarboksilasi untuk menghasilkan asid glutamat dengan kehadiran asid kuat.

Peptida seperti glukagon ialah ahli superfamili glukagon bagi hormon peptida yang berasal dari kawasan terminal C proglukagon. Mereka terutamanya disintesis oleh sel L usus.

Hormon pelepas gonadotropin (LHRH) ialah hormon dekapeptida yang dihasilkan dalam sel neurosecretory hipotalamus dan dilepaskan dalam semburan pulsatil ke dalam peredaran portal pituitari. Rembesan berdenyut adalah penting untuk fungsi pembiakan, perkembangan seksual, dan pembezaan.

Hormon pelepas hormon pertumbuhan (GHRH), juga dikenali sebagai somatorelin, ialah hormon peptida hipotalamus yang merangsang kelenjar pituitari untuk membebaskan dan mensintesis hormon pertumbuhan.

Hormon pelepas hormon pertumbuhan (GHRH), juga dikenali sebagai somatorelin, ialah hormon peptida hipotalamus yang merangsang kelenjar pituitari untuk membebaskan dan mensintesis hormon pertumbuhan.

Antigen leukosit manusia (HLA) merujuk kepada sekumpulan protein yang terdapat pada permukaan sel yang memainkan peranan penting dalam pengecaman sistem imun terhadap bahan asing. Mereka dikodkan oleh gen kompleks histokompatibiliti utama (MHC) pada manusia dan penting untuk pembentangan antigen kepada sel T, membolehkan sistem imun membezakan antara sel diri dan bukan diri. Molekul HLA sangat pelbagai dan polimorfik, menyumbang dengan ketara kepada tindak balas imun individu dan kerentanan terhadap penyakit autoimun dan penolakan pemindahan.

2-hidroksi-4-methoxybenzyl ialah kumpulan pelindung formamide labil asid yang digunakan untuk pengubahsuaian tulang belakang boleh balik dalam sintesis peptida. Ia digabungkan sebagai asid amino atau dipeptida Fmoc-Hmb (Fmoc-Xaa-HmbYaa-OH) semasa sintesis peptida Fmoc fasa pepejal (SPPS), menghalang pengagregatan dan membolehkan lanjutan peptida yang cekap. Hmb juga membantu dalam tindak balas kitaran dan menghalang pembentukan asparagin.

L-Homoarginin ialah homolog L-arginine, disingkatkan sebagai Har, dan boleh didapati dalam plasma dan air kencing. Homoarginine adalah hasil guanidinasi lisin, yang juga boleh dilakukan pada peptida dan protein.

Homocitrulline ialah homolog L-citrulline, disingkatkan sebagai Hci, dan boleh dikesan dalam air kencing manusia.

L-homocysteine ​​ialah homolog sistein, disingkatkan sebagai Hcy, dan dihasilkan oleh demetilasi metionin. Tahap Hcy darah yang tinggi adalah faktor risiko penyakit kardiovaskular dan neurodegeneratif. Berbeza dengan derivatif Cys, derivatif Hcy tidak berlumba semasa gandingan, begitu juga -elimin.

Homolog L-leucine, disingkatkan sebagai Hle.

Homophenylalanine, homolog fenilalanin, disingkatkan sebagai Hph, adalah komponen perencat ACE dan renin. Fmoc-Homophe-OH ialah ubat anti-radang yang berpotensi.

L-homoproline atau asid L-picolic, disingkatkan sebagai Pip atau Hpr. Homolog prolin Hpr ialah produk degradasi L-lisin. Kedua-dua enansiomer boleh dikesan dalam plasma manusia. Memandangkan sisa prolin sangat mempengaruhi pembentukan peptida, menggantikan Pro dengan Hpr (atau azetidine-2-asid karboksilik (Aze)) boleh memodulasi struktur sekundernya.

L-transhydroxyproline dihasilkan selepas translasi melalui pengoksidaan prolin. Hyp adalah komponen utama kolagen dan protein kerang.

Isoserine, isomer L-serine, ialah asid -amino.

ivDde, kumpulan pelindung amino, boleh dinyahlindungi dan dibelah oleh hidrat hidrazin 2% dalam DMF. ivDde adalah lebih stabil daripada Dde kepada rawatan piperidine yang kerap semasa Fmoc-SPPS. Nω-ivDde boleh dialih keluar secara terpilih daripada Dap, Dab Orn atau Lys, membenarkan pengubahsuaian pada resin pasca sintetik bagi kumpulan Nω-amino.

Hemosianin limpet lubang kunci (KLH) ialah metalloprotein multisubunit pembawa oksigen besar yang terdapat dalam hemolimfa hemocyanin limpet lubang kunci gergasi. Sebagai pembawa antigen, KLH biasanya meningkatkan imunogenisitas dan keupayaan penetapan antigen dengan menggandingkan jujukan polipeptida sasaran, dengan ketara menggalakkan penjanaan antibodi yang cekap, khusus dan berfungsi.

Hormon pelepas hormon lutein (LHRH atau GnRH) ialah hormon dekapeptida yang disintesis oleh sel neurosecretory dalam hipotalamus dan dilepaskan secara berdenyut ke dalam peredaran portal pituitari. Rembesan berdenyut adalah penting untuk fungsi pembiakan, perkembangan seksual, dan pembezaan.

Dalam reka bentuk dan sintesis peptida, penyelidik boleh memasukkan penghubung antara biotin atau pendarfluor dan peptida. Pengatur jarak hidrofobik biasa ialah asid aminoheksanoik (Ahx), dan pengatur jarak hidrofilik biasa ialah poli(etilena) glikol (PEG).

Proses pengeringan beku, yang mengeluarkan cecair daripada bahan sensitif haba. Bahan ini dibekukan, diletakkan di bawah vakum tinggi, dan disimpan pada suhu rendah. Tekanan yang dicipta oleh vakum menyebabkan ais berubah daripada keadaan pepejal kepada keadaan gas tanpa melalui keadaan cecair. Peptida biasanya dihantar sebagai serbuk lyophilized.

Kromatografi Cecair-Spektrometri Jisim ialah teknik analisis serba boleh yang mengintegrasikan kromatografi cecair dengan spektrometri jisim untuk memberikan maklumat terperinci tentang komposisi dan struktur molekul dalam sampel kompleks.

Peptida Antigen Berbilang. Peptida Antigen Berbilang ialah satu cara yang mujarab untuk menghasilkan antibodi anti-peptida titer tinggi dan vaksin peptida sintetik.

Matriks-Assisted Laser Desorption/Ionization Mass Spectrometry (MALDI-MS) ialah teknik analisis yang digunakan untuk mengukur nisbah jisim-ke-cas bagi ion. Ia amat berguna untuk analisis biomolekul seperti peptida, protein dan polimer.

Spektrometri jisim (MS) ialah teknik analisis berkuasa yang digunakan untuk mengukur nisbah jisim-ke-cas (m/z) ion.

4-Methoxy- -naphthylamide, disingkatkan sebagai MNA, ialah fluorophore yang biasanya dilekatkan pada substrat carboxypeptidase di terminal C. 4M NA terbelah menguja pada 335-350 nm dan memancarkan pada 410-440 nm

Methoxybenzenesulfonyl (Mbs) ialah kumpulan pelindung guanidyl yang digunakan dalam sintesis peptida fasa pepejal berasaskan Boc (Boc-SPPS). Kumpulan pelindung ini boleh dinyahlindungi oleh pembelahan dengan hidrogen fluorida (HF).

4-Methylbenzyl (Mbzl) ialah kumpulan pelindung sulfhidril yang digunakan dalam sintesis peptida fasa pepejal berasaskan Boc (Boc-SPPS). Mbzl lebih stabil daripada methoxybenzyl (Mob) di bawah rawatan asid trifluoroacetic (TFA) yang kerap dan boleh disingkirkan oleh pembelahan hidrogen fluorida (HF).

(7-Methoxycoumarin-4-yl)asid asetik (Mca) ialah fluorophore yang boleh dikaitkan dengan kumpulan amino.
Mca mengikat kepada dinitrophenyl (Dnp) untuk substrat pemindahan tenaga resonans pendarfluor (FRET). Panjang gelombang pengujaan ialah 325 nm, dan panjang gelombang pancaran ialah 392 nm.

Hormon penumpuan melanin (MCH) ialah neuropeptida kitaran yang pertama kali diasingkan daripada ikan dan tikus. MCH terlibat terutamanya dalam mengawal pigmentasi kulit dalam ikan teleost dan tingkah laku pemakanan dalam mamalia.

Metil, substituen alkil termudah, terlibat dalam N-, O-, dan S-metilasi, yang membentuk pengubahsuaian kekal peptida.

3-Methoxysuccinyl, sepadan dengan Asp(OMe) ternyahamin, ialah kumpulan penyekat terminal N kutub yang biasanya digabungkan ke dalam substrat karboksipeptidase.

Metilasi ialah pengubahsuaian selepas translasi (PTM) peptida dan protein di mana kumpulan metil (-CH3) ditambah secara enzimatik kepada residu asid amino tertentu, biasanya lisin (Lys), arginin (Arg), histidin (His), atau glutamat ( Glu). Pengubahsuaian ini boleh mempengaruhi fungsi protein, kestabilan, dan interaksi dengan molekul lain dengan ketara, dengan itu memainkan peranan penting dalam mengawal selia proses selular yang pelbagai termasuk ekspresi gen, transduksi isyarat, dan interaksi protein-protein.

Kompleks histokompatibiliti utama (MHC) ialah kawasan genetik yang mengandungi gen yang mengekod molekul MHC. Molekul ini memainkan peranan penting dalam sistem imun dan autoimun. Pada manusia, kompleks ini juga dikenali sebagai sistem antigen leukosit manusia (HLA).

Molekul MHC kelas I (MHC I) ialah protein pada permukaan sel yang membentangkan peptida dari dalam sel kepada sel T sitotoksik. Ini membantu sel imun mengenali dan memusnahkan sel yang dijangkiti atau tidak normal, penting untuk pertahanan imun terhadap patogen dan kanser.

Molekul MHC kelas II (MHC II) ialah protein permukaan sel yang membentangkan peptida yang diperoleh daripada bahan asing kepada sel T penolong. Interaksi ini penting untuk menyelaraskan tindak balas imun dan mengaktifkan sel imun lain terhadap patogen.

Monomethylated arginine (MMA) ialah pengubahsuaian selepas translasi di mana satu kumpulan metil (-CH3) ditambah secara enzimatik kepada nitrogen guanidino bagi residu arginin dalam peptida atau protein

3-mercaptopropylamine, boleh digunakan sebagai ligan peptida atau pengubah suai dalam pelbagai aplikasi biokimia dan bioperubatan.

Myristoylation ialah proses pengubahsuaian lipid di mana kumpulan myristoyl, yang terdiri daripada 14-asid lemak tepu karbon, dikaitkan secara kovalen kepada terminal-N peptida. Pengubahsuaian ini berfungsi untuk menambat protein pada membran sel, memudahkan penyetempatan dan penyertaannya dalam pelbagai proses selular.

-(1-naphthyl)-L-alanine ialah terbitan asid amino nonpolar yang serupa dengan fenilalanin, tetapi dengan kumpulan naphthyl dan bukannya kumpulan fenil.

-(2-Naphthyl)alanine ialah terbitan asid amino nonpolar yang serupa dengan fenilalanin, tetapi dengan kumpulan naphthyl dan bukannya kumpulan fenil.

3-nitrobenz-2-oxa-1, 3-diazol (NBD) biasanya diperkenalkan dengan mengkonjugat reagen NBD-Cl kepada peptida. Peptida berlabel NBD dipilih secara meluas untuk kegunaannya dalam kajian yang memfokuskan pada membran dan biologi sel.

N-Ethylamide boleh dianggap sebagai bentuk dekarboksilasi alanin terminal-C. Dalam buserelin agonis LHRH, NHEt berfungsi sebagai analog glycinamide terminal C. Peptida N-ethylamide tahan terhadap degradasi oleh carboxypeptidases.

L-norleucine (Nle) ialah isoster L-metionine yang stabil. Apabila aktiviti biologi peptida terjejas disebabkan oleh pembentukan sulfoksida, Nle boleh digantikan dengan Met tanpa biasanya mengubah tingkah laku fungsinya.

NOTA, 1,4,7-triazacyclononane-1,4,7-asid triacetic, ialah chelator dwifungsi yang berfungsi sebagai rangka kerja untuk membina alat pengimejan PET. Ia juga digunakan dalam reka bentuk probe dan penguatan isyarat melalui kesan multivalen dan memegang potensi aplikasi sebagai radiofarmaseutikal galium diagnostik.

N-Me biasanya merujuk kepada N-metilasi, pengubahsuaian kimia di mana kumpulan metil (-CH 3 ) dilekatkan pada atom nitrogen dalam molekul, seperti N-Me-Gly, N-Me-Ser, N -Me -Tyr, N-Me-Thr, N-Me-Asp, N-Me-Glu, N-Me-Ala, N-Me-Phe, N-Me-Leu, N-Me-Ile, N-Me -Val, N-Me-Met, N-Me-Nle, N-Me-Nva, dsb.

NODAGA,1,4,7-triazacyclononane,1-asid glutarik-4,7-asid diacetik, ialah chelator dwifungsi yang luar biasa untuk reka bentuk dan pembangunan radiofarmaseutikal organologam, menawarkan potensi untuk aplikasi dalam pengimejan diagnostik dan radioterapi yang disasarkan.

2-Nitrophenylthio (Nps) ialah kumpulan pelindung-S yang digunakan dalam sintesis peptida fasa pepejal berasaskan Boc (Boc-SPPS). Ia boleh dibelah oleh tiol, khususnya melalui kumpulan sulfhidril bebas sistein (Cys), yang membawa kepada pembentukan serentak ikatan disulfida.

Neuropeptide Y (NPY) ialah neuropeptida yang menonjol dalam otak dan sebahagian daripada keluarga neuropeptida Y, yang merangkumi polipeptida pankreas (PP) dan peptida YY (PYY).

2-Nitro-2-pyridylsulfenyl (Npys) ialah kumpulan pelindung-S yang serasi dengan sintesis peptida fasa pepejal berasaskan Boc (Boc-SPPS). Npys boleh dibelah oleh tiol, khususnya melalui kumpulan sulfhidril bebas sistein (Cys), mengakibatkan pembentukan serentak ikatan disulfida.

Norvaline ialah asid amino alifatik nonpolar dan homolog asid -aminobutirik (Abu).

-Naphthylamide ialah fluorophore yang biasa digunakan dalam substrat karboksipeptidase, biasanya dikaitkan pada terminal-C peptida. NA terbelah mengujakan pada 330 nm dan memancarkan pada 370 nm.

-Naphthylamide ialah fluorophore yang biasa digunakan dalam substrat karboksipeptidase, biasanya dikaitkan pada terminal-C peptida. NA terbelah pada 320-340 nm, pancaran pada 410-420 nm.

Allyl ester ialah kumpulan pelindung karboksil yang serasi dengan sintesis peptida fasa pepejal (SPPS) berasaskan Fmoc dan Boc. Sama seperti Aloc, ester alil boleh disingkirkan secara selektif dengan rawatan dengan Pd(PPh3)4. Dalam Fmoc-SPPS, Asp(OAll) terdedah kepada pembentukan aspartimide yang dimangkinkan asas.

Benzyl ester, kumpulan pelindung karboksil, boleh disingkirkan melalui penghidrogenan pemangkin (cth H2/Pd) atau asid kuat.

OcHex ialah kumpulan pelindung karboksil standard yang digunakan dalam sintesis peptida fasa pepejal berasaskan Boc (Boc-SPPS).

4-(N-[1(4,4-Dimetil-2,6-dioxocyclohexylidene)-3-etilbutil]amino)benzil ester (ODmab) ialah pelindung karboksil kumpulan yang digunakan dalam sintesis peptida fasa pepejal berasaskan Fmoc (Fmoc-SPPS). Ia boleh dibelah dan dinyahlindung menggunakan hidrat hidrazin 2% dalam DMF.

2,4-Dimethoxybenzyl ester ialah kumpulan pelindung karboksil yang sangat labil asid yang boleh dialih keluar menggunakan 1% TFA dalam diklorometana.

Etil ester, Disebabkan syarat ketat yang diperlukan untuk penyingkiran etil ester, mengubah suai peptida dengan etil ester boleh meningkatkan lipofilis dan kestabilannya.

9-Ester fluorenylmetil ialah kumpulan pelindung karboksil asas-labil yang boleh dialih keluar menggunakan piperidine dalam DMF.

Ester heksil, Disebabkan syarat ketat yang diperlukan untuk penyingkiran etil ester, mengubah suai peptida dengan etil ester boleh meningkatkan lipofilis dan kestabilannya.

L-Otahydroindole-2-asid karboksilik (Oic) ialah asid amino terhalang nonpolar. Kemasukan asid amino berkaitan prolin ini ke dalam jujukan polipeptida sangat mempengaruhi konformasi peptida.

Metil ester ialah kumpulan pelindung terminal C separa kekal dalam sintesis fasa cecair, dan ia boleh ditukar menjadi peptida hidrazida, prekursor peptida azida reaktif. Gandingan azida kekal sebagai kaedah gandingan serpihan yang paling popular dalam sintesis peptida fasa cecair.

3-Methylpent-3-yl ester (OMpe) ialah kumpulan pelindung karboksil labil asid yang kerap digunakan untuk melindungi kumpulan karboksil asid aspartik (Asp) dalam sintesis peptida fasa pepejal berasaskan Fmoc (Fmoc-SPPS ).Analog ester tert-butil yang lebih tegas ini telah dibangunkan khusus untuk mengurangkan pembentukan asparagimida bermangkin asas.

Ester orto-nitrofenil bagi asid Boc- atau Z-amino ialah derivatif praaktif yang digunakan dalam sintesis larutan peptida.

Ornithine (Orn) dihasilkan daripada arginin semasa kitaran urea dan juga boleh diperhatikan dalam peptida sebagai produk degradasi arginin. Pembentukan orn melalui asilasi bahagian guanidine arginin adalah tindak balas sampingan yang biasa dalam sintesis peptida.

Hydroxysuccinimide ester (OSu, singkatan NHS) ialah derivatif asid amino praaktif yang biasa digunakan dalam sintesis peptida, terutamanya pengubahsuaian peptida. Ester OSu adalah selamat, tidak steril, serasi dengan sistem akueus dan mudah dikendalikan.

Tert-butil ester, kumpulan pelindung karboksil labil asid untuk asid amino dalam sintesis peptida.

4-asid aminobenzoik (asid para-aminobenzoik), Boleh digunakan untuk sintesis penyambung konjugat antibodi-ubat. Contohnya, Mal-PEG2-Val-Cit-PABA ialah penghubung konjugat ubat antibodi boleh belah (ADC).

PABC (para-aminobenzyl carbamate) ialah sebatian kimia yang digunakan dalam sintesis konjugat antibodi-ubat (ADC) sebagai penghubung. Ia memudahkan perlekatan ubat kepada antibodi secara terkawal, membolehkan penghantaran ubat yang disasarkan dalam terapi kanser dan aplikasi bioperubatan lain. Sebagai contoh, Mc-Val-Cit-PABC-PNP ialah penghubung boleh belah cathepsin yang digunakan dalam konjugat ubat antibodi (ADC).

Pituitari adenylate cyclase-activating polypeptide (PACAP) ialah neuropeptida yang sangat terpelihara yang dinyatakan dengan jelas di seluruh otak mamalia. Ia memberikan kesan biologinya dengan meningkatkan tahap AMP kitaran intraselular melalui interaksi reseptor.

Palmitoyl, kumpulan asil nonpolar yang diperkenalkan pada terminal-N atau sisi. Palmitoylation juga telah diperhatikan sebagai pengubahsuaian selepas translasi protein.

Resin metil Phenylacetamide ialah resin yang direka khusus untuk sintesis peptida fasa pepejal berasaskan Boc (Boc-SPPS). Peptida yang disintesis pada resin ini boleh dilepaskan menggunakan belahan HF.

Dalam Antibody-Drug Conjugates (ADCs), penghubung menghubungkan antibodi kepada muatan sitotoksik. Pilihan muatan adalah penting kerana ia menentukan keberkesanan dan kekhususan ADC dalam menyampaikan terapi kepada tisu sasaran melalui mekanisme pelepasan tertentu.

2,2,4,6,7-Pentamethyldihydrobenzofuran-5-sulfonil (Pbf) ialah kumpulan pelindung guanidino pilihan yang digunakan dalam sintesis peptida fasa pepejal berasaskan Fmoc (Fmoc-SPPS). Ia mempamerkan kebolehan asid yang lebih tinggi sedikit berbanding Pmc.

Penicillamine ialah analog L-cysteine ​​yang dicirikan oleh penggantian kumpulan metil (-CH3) dengan asid karboksilik (-COOH).

Pengumpulan diri peptida ialah apabila peptida secara semula jadi menyusun diri mereka menjadi struktur tersusun tanpa campur tangan luar. proses ini didorong oleh interaksi bukan kovalen seperti ikatan hidrogen, interaksi hidrofobik, daya elektrostatik, dan susunan π-π. Pengumpulan diri peptida boleh membawa kepada pembentukan pelbagai struktur nano termasuk gentian, sfera, kepingan dan gel, yang mempunyai aplikasi dalam sains bahan, bioteknologi dan perubatan.

Phenylacetyl (Phenylac atau Phac) ialah kumpulan asil yang biasanya dikaitkan pada terminal-N peptida, dicirikan oleh kekutuban yang lebih rendah berbanding dengan asetil (Ac). Ia membentuk pengubahsuaian kekal peptida.

fenilglisin (Phg) ialah terbitan asid amino di mana kumpulan fenil menggantikan atom hidrogen dalam molekul glisin.

Peptide Histidine Isoleucine (PHI), peptida babi yang berkaitan dengan VIP dan secretin.

Peptide histidine methionine (PHM), peptida manusia yang berkaitan dengan VIP.

Titik isoelektrik (pI) ditakrifkan sebagai tahap pH di mana protein/peptida mempunyai cas bersih sifar (Smoluch et al., 2016).

2,2,5,7,8-Pentamethylchroman-6-sulfonil (Pmc) ialah kumpulan pelindung guanidinyl yang biasa digunakan dalam sintesis peptida fasa pepejal berasaskan Fmoc (Fmoc-SPPS). Ia terkenal sebagai kurang tahan asid berbanding Pbf.

p-Nitroaniline, kromofor, biasanya terkonjugasi kepada terminal C substrat carboxypeptidase. Penyerapan p-nitroaniline yang dibebaskan biasanya diukur pada panjang gelombang sekitar 405 atau 410 nm.

L-Propargylglycine (Pra) dihasilkan oleh mikroorganisma. Asid amino ini, yang dicirikan oleh struktur ikatan rangkap tiganya, dipandang tinggi sebagai unit asas untuk mensintesis peptida yang mampu terlibat dalam tindak balas "kimia klik", mendapat perhatian penting dalam bidang ini.

Hormon paratiroid (PTH) ialah hormon peptida yang dikeluarkan oleh kelenjar paratiroid, penting untuk mengekalkan homeostasis kalsium dan fosforus dalam cecair ekstraselular.

Pengubahsuaian selepas translasi (PTM) protein menambah kumpulan berfungsi atau protein, memotong subunit kawal selia atau memecahkan keseluruhan protein. Perubahan ini, seperti fosforilasi, glikosilasi, metilasi, asetilasi, lipidasi, ubiquitination, nitrosilasi dan proteolisis, mempengaruhi cara sel berfungsi secara normal dan semasa penyakit. Memahami PTM adalah penting untuk penyelidikan asas dan mencari rawatan baharu.

asid pyroglutamic, juga dikenali dengan singkatan seperti Pgl, Glp, pGlu, atau

phenylazobenzylmethoxycarbonyl ialah kumpulan pelindung N kromoforik yang digunakan dalam sintesis peptida, boleh dibelah oleh penghidrogenan pemangkin atau asid kuat. Ia mempamerkan panjang gelombang penyerapan maksimum pada 229 nm, 320 nm, dan 441 nm.

Sepasang pelindapkejut terdiri daripada molekul pendarfluor (fluorophore) dan molekul pelindapkejut yang digunakan dalam penyelidikan dan ujian berasaskan pendarfluor. Pelindapkejutan menyerap cahaya yang dipancarkan oleh fluorophore, mengurangkan pendarfluornya. Apabila fluorophore dan quencher dipisahkan, seperti melalui tindak balas biokimia, isyarat pendarfluor meningkat. Ini membolehkan penyelidik mengukur perubahan dan interaksi masa nyata. Teknik ini biasanya digunakan dalam aplikasi seperti ujian PCR masa nyata, probe molekul dan FRET (Förster Resonance Energy Transfer).

Fluorin-18 ialah radioligan yang biasa digunakan dalam pengimejan PET untuk menilai metabolisme glukosa dalam tisu dan biasanya digunakan dalam diagnosis kanser dan pengimejan otak.

Pustaka peptida rawak ialah koleksi banyak jujukan peptida pendek yang dijana secara rawak. Setiap peptida dalam perpustakaan mempunyai bilangan asid amino tertentu dengan urutan yang ditentukan secara rawak, mewujudkan pelbagai molekul peptida. Penyelidik menggunakan perpustakaan ini untuk menyaring peptida dengan sifat tertentu, aktiviti biologi atau interaksi dengan molekul sasaran. Ia amat berguna dalam penemuan ubat, imunologi, dan kajian interaksi protein-protein, membantu mengenal pasti terapeutik baharu dan memahami proses biologi yang kompleks.

Sisa ialah asid amino individu dalam peptida atau protein. Apabila asid amino bergabung bersama melalui ikatan peptida untuk membentuk rantai ini, setiap unit asid amino dipanggil residu. Istilah ini digunakan kerana semasa pembentukan ikatan peptida, setiap asid amino kehilangan molekul air (H2O), meninggalkan apa yang disebut sebagai residu.

Resin ialah polimer tidak larut yang digunakan dalam sintesis peptida fasa pepejal (SPPS) sebagai sokongan pepejal untuk penambahan berterusan asid amino. Manik resin menyediakan permukaan yang stabil dan lengai di mana asid amino awal dilekatkan secara kovalen, membolehkan rantai peptida dibina residu demi residu.

Rhodamine B ialah pewarna merah jambu hingga merah terang dengan panjang gelombang pengujaan biasanya sekitar 540-570 nm dan julat cahaya yang dipancarkan sebanyak 560-580 nm. Ia biasanya terkonjugasi kepada urutan peptida melalui kumpulan amino N-terminal peptida.

Kromatografi cecair berprestasi tinggi fasa terbalik.

Ubat Structure-Activity Relationship (SAR) dibangunkan dengan mengkaji hubungan antara struktur kimia ubat dan aktiviti biologinya.

Sarcosine, asid amino beralkilasi N yang paling mudah.

Dimetilarginin simetri(SDMA, Arg(Me)2), Fmoc-Arg(Me)2-OH (simetri) boleh digunakan terus untuk sintesis peptida yang mengandungi dimethylarginine simetri.

Sintesis peptida fasa pepejal (SPPS) ialah kaedah untuk sintesis kimia peptida, di mana peptida dipasang secara berperingkat pada sokongan pepejal atau resin dengan menambahkan asid amino terlindung secara berurutan. SPPS merangkumi dua strategi: Fmoc-SPPS dan Boc-SPPS, yang berbeza dalam pilihan kumpulan perlindungan kumpulan N -amino (Fmoc atau Boc) dan kumpulan pelindung rantai sisi. Jenis kumpulan pelindung N -amino yang dipilih menentukan strategi perlindungan rantai sisi dan syarat untuk pembelahan akhir peptida daripada resin.

Statine, disingkat sebagai Sta, ialah asid amino bukan protein yang sering digunakan dalam reka bentuk mimetik peptida, terutamanya dalam sintesis perencat protease.

Tert-Butylthio (StBu) ialah kumpulan pelindung-S yang dibelah oleh pengurangan fosfin dan serasi dengan Boc-SPPS.

Succinyl ialah pengubahsuaian terminal N kutub yang sepadan dengan aspartat ternyah dan biasanya digabungkan ke dalam substrat karboksipeptidase.

TAMRA, juga disingkatkan sebagai TMR, ialah fluorophore yang boleh dilekatkan pada kumpulan amino. Ia sering digunakan dalam kombinasi dengan FAM untuk substrat FRET. TAMRA mempunyai panjang gelombang pengujaan 485 nm dan panjang gelombang pancaran 535 nm.

Tert-butil ialah kumpulan pelindung asid-labil yang biasa digunakan untuk alkohol dan fenol, yang boleh dibelah menggunakan asid trifluoroacetic (TFA).

Trietilammonium fosfat ialah penimbal yang digunakan dalam fasa mudah alih HPLC fasa terbalik.

Asid trifluoroacetic (TFA) digunakan untuk pembelahan peptida daripada resin dalam Fmoc-SPPS dan untuk penyingkiran kumpulan pelindung yang berasal dari tBu.

Asid trifluoromethanesulfonic (TFMSA) adalah asid yang lebih kuat daripada TFA. TFMSA boleh digunakan sebagai alternatif yang lebih selamat kepada HF yang sangat toksik untuk langkah pembelahan terakhir strategi Boc-SPPS.

L-tert-leucine (Tle) ialah asid amino nonpolar dengan rantai sampingan yang menuntut secara sterik yang menggugat kestabilan -heliks.

2,4,6-Trimethoxybenzyl ialah kumpulan pelindung Asn dan Gln amide yang tahan asid yang digunakan dalam Fmoc-SPPS.

Tosyl digunakan sebagai kumpulan pelindung untuk guanidine dan imidazole dalam Boc-SPPS, dan boleh dikeluarkan oleh Na/NH3

Trityl (Trt) ialah kumpulan pelindung tahan asid yang digunakan untuk Asn, Cys, Gln, dan sisa-sisanya dalam Fmoc-SPPS. Ia boleh dikeluarkan secara selektif menggunakan asid trifluoroacetic (TFA).

Peptida tulen biasanya wujud dalam keadaan serbuk putih selepas pengeringan beku.

Peptida usus vasoaktif (VIP) ialah 28-peptida asid amino kepunyaan superfamili peptida glukagon-ghrelin-secretin.

9-Xanthydryl (Xan) ialah kumpulan pelindung amida labil asid yang digunakan untuk sisa Asn dan Gln dalam Boc-SPPS. Xan boleh dialih keluar secara terpilih menggunakan TFA.

Apabila peptida dilabelkan dengan fluorescein FAM, serbuk lyophilized biasanya menunjukkan rupa kuning.

Z-benzyloxycarbonyl, disingkat sebagai Z atau Cbz, digunakan sebagai kumpulan pelindung amino dalam sintesis peptida. Ia boleh dikeluarkan menggunakan hidrogenolisis atau asid kuat sebagai HF kemas atau asid HBr/asetik.